MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 chromosome

Total Repeats: 57634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012034	AGG	2	6	85	90	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222528058
2	NC_012034	A	6	6	96	101	100 %	0 %	0 %	0 %	222528058
3	NC_012034	AAAT	2	8	103	110	75 %	25 %	0 %	0 %	222528058
4	NC_012034	AT	3	6	124	129	50 %	50 %	0 %	0 %	222528058
5	NC_012034	GAC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222528058
6	NC_012034	TAA	2	6	226	231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528058
7	NC_012034	TTC	2	6	301	306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528058
8	NC_012034	TGA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528058
9	NC_012034	TGT	2	6	407	412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528058
10	NC_012034	AAC	3	9	417	425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222528058
11	NC_012034	GCA	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222528058
12	NC_012034	ACC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222528058
13	NC_012034	GA	3	6	474	479	50 %	0 %	50 %	0 %	222528058
14	NC_012034	TTTA	2	8	495	502	25 %	75 %	0 %	0 %	222528058
15	NC_012034	ATGC	2	8	534	541	25 %	25 %	25 %	25 %	222528058
16	NC_012034	TCA	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222528058
17	NC_012034	TATG	2	8	584	591	25 %	50 %	25 %	0 %	222528058
18	NC_012034	AGAC	2	8	643	650	50 %	0 %	25 %	25 %	222528058
19	NC_012034	GAC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222528058
20	NC_012034	GGAAA	2	10	714	723	60 %	0 %	40 %	0 %	222528058
21	NC_012034	AAG	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528058
22	NC_012034	AAG	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528058
23	NC_012034	ATA	2	6	780	785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528058
24	NC_012034	TCA	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222528058
25	NC_012034	CCA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222528058
26	NC_012034	AGA	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528058
27	NC_012034	GCC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222528058
28	NC_012034	A	6	6	912	917	100 %	0 %	0 %	0 %	222528058
29	NC_012034	AAAC	2	8	979	986	75 %	0 %	0 %	25 %	222528058
30	NC_012034	ACACAA	2	12	1099	1110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222528058
31	NC_012034	A	7	7	1109	1115	100 %	0 %	0 %	0 %	222528058
32	NC_012034	ATC	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222528058
33	NC_012034	AAG	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528058
34	NC_012034	AGGCG	2	10	1274	1283	20 %	0 %	60 %	20 %	222528058
35	NC_012034	A	6	6	1324	1329	100 %	0 %	0 %	0 %	222528058
36	NC_012034	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	222528058
37	NC_012034	A	7	7	1383	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	222528058
38	NC_012034	AAT	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528058
39	NC_012034	TG	3	6	1427	1432	0 %	50 %	50 %	0 %	222528059
40	NC_012034	AT	3	6	1488	1493	50 %	50 %	0 %	0 %	222528059
41	NC_012034	TTA	2	6	1532	1537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222528059
42	NC_012034	TAC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222528059
43	NC_012034	GTA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528059
44	NC_012034	A	7	7	1623	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	222528060
45	NC_012034	AAG	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528060
46	NC_012034	ATA	2	6	1663	1668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528060
47	NC_012034	CTG	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222528060
48	NC_012034	CAA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222528060
49	NC_012034	GT	3	6	1721	1726	0 %	50 %	50 %	0 %	222528060
50	NC_012034	AAT	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528060
51	NC_012034	CTT	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528060
52	NC_012034	A	6	6	1860	1865	100 %	0 %	0 %	0 %	222528060
53	NC_012034	GAA	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528060
54	NC_012034	AGA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528060
55	NC_012034	TTG	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528060
56	NC_012034	TTG	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528060
57	NC_012034	AGA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528060
58	NC_012034	TGA	2	6	2111	2116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528060
59	NC_012034	TTG	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528060
60	NC_012034	GAAG	2	8	2184	2191	50 %	0 %	50 %	0 %	222528060
61	NC_012034	CTG	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222528060
62	NC_012034	GAT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528060
63	NC_012034	T	6	6	2277	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	222528060
64	NC_012034	CAA	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222528060
65	NC_012034	ATTTCA	2	12	2391	2402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222528060
66	NC_012034	A	6	6	2455	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	222528060
67	NC_012034	ATG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528060
68	NC_012034	CTG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222528060
69	NC_012034	GAA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528060
70	NC_012034	GAC	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222528060
71	NC_012034	TTC	2	6	2710	2715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528060
72	NC_012034	ACAA	2	8	2801	2808	75 %	0 %	0 %	25 %	222528061
73	NC_012034	T	6	6	2812	2817	0 %	100 %	0 %	0 %	222528061
74	NC_012034	TAA	2	6	2850	2855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528061
75	NC_012034	CTTCT	2	10	2870	2879	0 %	60 %	0 %	40 %	222528061
76	NC_012034	TG	3	6	2900	2905	0 %	50 %	50 %	0 %	222528061
77	NC_012034	TTCT	2	8	2949	2956	0 %	75 %	0 %	25 %	222528061
78	NC_012034	AAT	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528061
79	NC_012034	T	6	6	3103	3108	0 %	100 %	0 %	0 %	222528061
80	NC_012034	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528061
81	NC_012034	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528061
82	NC_012034	AGG	2	6	3335	3340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222528061
83	NC_012034	TAAA	2	8	3344	3351	75 %	25 %	0 %	0 %	222528061
84	NC_012034	TTTAG	2	10	3376	3385	20 %	60 %	20 %	0 %	222528061
85	NC_012034	AT	3	6	3417	3422	50 %	50 %	0 %	0 %	222528061
86	NC_012034	TGC	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222528061
87	NC_012034	A	6	6	3468	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	222528061
88	NC_012034	ACA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222528061
89	NC_012034	GATA	2	8	3543	3550	50 %	25 %	25 %	0 %	222528061
90	NC_012034	A	6	6	3550	3555	100 %	0 %	0 %	0 %	222528061
91	NC_012034	CTTCT	2	10	3620	3629	0 %	60 %	0 %	40 %	222528061
92	NC_012034	A	6	6	3690	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	222528061
93	NC_012034	AGA	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528061
94	NC_012034	AGA	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528061
95	NC_012034	AAG	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528061
96	NC_012034	A	7	7	3821	3827	100 %	0 %	0 %	0 %	222528061
97	NC_012034	CTT	2	6	3899	3904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528062
98	NC_012034	TTG	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528062
99	NC_012034	ATG	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528062
100	NC_012034	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	222528062
101	NC_012034	GAA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528062
102	NC_012034	AAT	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528062
103	NC_012034	ATT	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222528063
104	NC_012034	TA	3	6	4267	4272	50 %	50 %	0 %	0 %	222528063
105	NC_012034	AG	3	6	4286	4291	50 %	0 %	50 %	0 %	222528063
106	NC_012034	TTG	2	6	4316	4321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528063
107	NC_012034	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	222528063
108	NC_012034	TTC	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528063
109	NC_012034	TGT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222528063
110	NC_012034	GAAGTT	2	12	4579	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528063
111	NC_012034	AACC	2	8	4634	4641	50 %	0 %	0 %	50 %	222528063
112	NC_012034	TAC	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222528063
113	NC_012034	GACAG	2	10	4669	4678	40 %	0 %	40 %	20 %	222528063
114	NC_012034	TGA	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528063
115	NC_012034	GA	4	8	4807	4814	50 %	0 %	50 %	0 %	222528063
116	NC_012034	A	7	7	4814	4820	100 %	0 %	0 %	0 %	222528063
117	NC_012034	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222528063
118	NC_012034	TA	3	6	4911	4916	50 %	50 %	0 %	0 %	222528063
119	NC_012034	TGCAG	2	10	4953	4962	20 %	20 %	40 %	20 %	222528063
120	NC_012034	AGA	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528063
121	NC_012034	AAC	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222528063
122	NC_012034	CTG	2	6	5051	5056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222528063
123	NC_012034	A	6	6	5082	5087	100 %	0 %	0 %	0 %	222528063
124	NC_012034	CTT	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528063
125	NC_012034	GACA	2	8	5189	5196	50 %	0 %	25 %	25 %	222528063
126	NC_012034	T	6	6	5265	5270	0 %	100 %	0 %	0 %	222528063
127	NC_012034	AGA	2	6	5271	5276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222528063
128	NC_012034	A	6	6	5292	5297	100 %	0 %	0 %	0 %	222528063
129	NC_012034	GGC	2	6	5319	5324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222528063
130	NC_012034	A	6	6	5343	5348	100 %	0 %	0 %	0 %	222528063
131	NC_012034	AG	3	6	5353	5358	50 %	0 %	50 %	0 %	222528063
132	NC_012034	TAA	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528063
133	NC_012034	CTT	2	6	5590	5595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528063
134	NC_012034	TTGGAA	2	12	5618	5629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222528063
135	NC_012034	ATA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222528063
136	NC_012034	CTT	3	9	5713	5721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222528063
137	NC_012034	AATG	2	8	5904	5911	50 %	25 %	25 %	0 %	222528063
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497	NC_012034	ATTG	2	8	22047	22054	25 %	50 %	25 %	0 %	222528070
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